怎么在图表中显示数据的聚类分析结果 GraphPad如何生成聚类热图

品牌型号：联想GeekPro 2020

系统：Windows 10 64位专业版

软件版本：GraphPad 10.3.0

聚类分析，其实就是将大量的样本简化为少数类别的方法。“聚类”两字也说明了这个分析方法是将数据聚集起来，然后归类的方法。什么地方会用到聚类分析呢？比较常用的是人群细分、社群分析、客户分类等，大多数跟群体分析有关。接下来，本文会给大家介绍怎么在图表中显示数据的聚类分析结果，GraphPad如何生成聚类热图的相关内容。

一、怎么在图表中显示数据的聚类分析结果

想要在图表中显示数据的聚类分析结果，一般要用到专业的数据分析软件，本文会以GraphPad为例，教大家具体怎么操作。GraphPad是一款专业的数据处理与图形制作软件，如果大家对图表的制作要求比较高，用GraphPad就对了，可以省掉很多格式化图表的时间。

1、在GraphPad进行聚类分析，要用到多变量数据表。我们只要在GraphPad的欢迎页面的左侧，选择“multiple variables”就可以了。

2、多变量数据表，顾名思义，就是包含多列变量的数据表。虽然与column数据表有点像，但可以做的分析不同，大家注意不要搞混。

3、创建好数据表后，导入已经准备好的数据。这里我们导入了四个变量的数据，分别是指标1、2、3、4变量，可以看到，多变量数据表单元格里面都是数字，没有字符标题。

4、完成数据的导入后，如图4所示，打开GraphPad顶部的分析菜单，然后依次选择聚类（clustering）-K均值聚类（K-means clustering）。

5、然后，GraphPad会跳转到“分析数据”的设置窗口，一般按照默认设置就可以了，不用调整选项，除非是要减少分析的变量。如果要减少的话，在右侧变量选项取消勾选就可以了。

6、在K均值聚类分析设置中，如图6所示，重点是要打开“结果（output）”选项卡，我们可以勾选一些额外的报告，比如聚类细节、标准化数据等。这样我们在看结果的时候，就可以多参考一下其他的数据。

6、在图表设置上，GraphPad的K均值聚类分析可输出肘部图（Elbow plot）、Silhouette图以及Gap图，三种图表都可以看聚类的数量。

7、下面我们简单看一下GraphPad K均值聚类的分析结果。对于本例数据，聚类为3个类别时，已解释方差的百分比（percent of explained variation）较大（49.49%），说明聚类分析的效果比较好。

8、聚类分析的肘部图主要是看坡度的平缓处，因为平缓处的WCSS（总聚类内平方和）的数值减少幅度变得很小，说明这个点后已经不能显著减少误差。这样我们就能在这个点找到最佳聚类数量，本例数据是在类别数量=3时，WCSS到达平缓处。

二、GraphPad如何生成聚类热图

上述我们主要介绍的是GraphPad的K均值聚类。如果要生成聚类热图，要使用GraphPad的分层聚类方法。

1、在GraphPad顶部的分析菜单中，我们可以在聚类分析大类中找到“分层聚类（Hierarchical clustering）”。

2、同样地，GraphPad会跳转到分析数据窗口，保持默认设置就可以了。

3、然后，在分层聚类设置面板中，我们要打开“图表”选项卡。如图12所示，在分层聚类的图表选项中，可以找到热图（Heatmap）的选项，勾选这个选项，我们就能在输出结果里面得到聚类热图。

4、GraphPad生成的聚类热图如图13所示，颜色越相近的样本，越能归属到同一个类别，比如第二层到第五层的颜色都比较深，可以将它们归为一类。而从第六层开始，颜色都比较浅，可以将第六层开始到最后都归为一类。

三、小结

以上就是关于怎么在图表中显示数据的聚类分析结果，GraphPad如何生成聚类热图的相关内容。GraphPad的聚类分析结果很丰富，如果您要画一些图表来展示数据，GraphPad可以输出肘部图、Silhouette图、Gap图、热图等图表，可以省掉很多画图的时间。而且GraphPad的图表都比较美观，不用花很多时间美化，用起来很方便。

作者：泽洋