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GraphPad做ROC曲线如何得出cutoff值 GraphPad做ROC曲线怎么添加成方框图

发布时间:2025-08-19 08: 00: 00

品牌型号:联想 小新14

系统:Windows 10

软件版本:GraphPad 10.4.0(621)

在临床诊断与生物医学研究中,ROC曲线是评估诊断试验效能的核心工具。GraphPad作为一款功能多样的绘图软件,不仅支持快速生成ROC曲线,还可通过内置分析功能计算出最佳Cutoff值,为临床决策提供量化依据。今天我们将要和大家一起分享关于GraphPad做ROC曲线如何得出cutoff值,GraphPad做ROC曲线怎么添加成方框图的内容。

一、GraphPad做ROC曲线如何得出cutoff值

ROC曲线是受试者工作特征曲线,以真阳性率就是灵敏度为纵坐标,假阳性率就是特异性为横坐标绘制的曲线。用于比较两种或两种以上不同诊断试验对疾病的识别能力,接下来我们一起来学习关于GraphPad做ROC曲线如何得出cutoff值的具体操作步骤:

1、收集数据,如下图所示,数据的第一列是对照组,第二列是收集到的一个肿瘤实验的一个数据。现在我们用GraphPad软件对这两列数据做ROC曲线分析。

收集数据
图1:收集数据

2、打开我们的GraphPad软件,在主界面选择第二个Column选项。因为我们的两组数据没有对应关系,所以右边的Data table和Option都是选择第一个选项。最后点击创建按钮,新建空白数据表。

创建数据表
图2:创建数据表

3、把准备好的数据粘贴到表格中,把数据输入进来后,点击图表上方的analyze分析。这时会弹出Analyze Data对话框。在Column analyses选项里面找到ROC Curve,我们点击ROC Curve,右侧选中AB列数据,然后点击OK按钮。

进行ROC分析
图3:进行ROC分析

4、弹出Parameters: ROC Curve参数设置页面,这里可以看到Control values设置的是正常值,Patient values设定的是病人值,置信区间是95%等,如果没有特别需求,我们选择默认设置点击OK按钮。

参数设置
图4:参数设置

5、生成roc曲线报告,报告结果有两份,一个是Area ,另一个是Sensitivity & Specificity。在Area页面可以查看AUC值和P值。Sensitivity & Specificity页面可以查看灵敏度以及特异度的数据。该页面的第一列数据就是我们要找的cutoff值。

得到cutoff值
图5:得到cutoff值

6、如果我们想知道最佳的cutoff值,可以在ROC分析结果表中,找到Sensitivity和Specificity列,计算每行的(灵敏度+特异度-1)值,然后选取计算结果最大值对应的截断点就是最佳cutoff值。

计算得出最佳cutoff值
图6:计算得出最佳cutoff值

二、GraphPad做ROC曲线怎么添加成方框图

方框图又称箱线图,是一种通过图形化方式展示数据分布特征的统计图表。上文我们已经学习了在GraphPad中分析roc曲线并得出了cutoff值,下面我们一起来学习在GraphPad中做ROC曲线怎么添加成方框图的具体操作步骤。

1、我们根据上文的步骤流程操作可以得到ROC曲线分析结果,下一步来绘制图形。首先在左侧任务栏,点击Graphs里的Data1。弹出Change Graph Type窗口,在弹出的窗口中,选择图表类型。

生成ROC结果
图7:生成ROC结果

2、选择Box and violin选项,下面会出现多个箱线图和小提琴类型的图表,这里我们选择第一幅图。点击OK按钮,就会自动生成一幅方框图。接下来可以对生成的图表进行微调。

绘制方框图
图8:绘制方框图

3、调整样式格式,双击图表,弹出Format Graph对话框,点击Data set选项选择要调整的箱体,如这里先选择正常组,然后在Bars and boxes中选择填充色为蓝色,修改线条宽度为1pt,边框线条的颜色也修改成蓝色和箱体一致。

4、然后在Data set选项里更换肿瘤组,同样在Bars and boxes中选择填充色,以及修改线条宽度,边框线条的颜色也修改成和箱体一致,最后点击Apply按钮预览图表。

调整图表样式
图9:调整图表样式

5、如果想要生成的方框图里显示数据点,那么我们可以勾选Symbols选项。在下方找到Symbols选项,并勾选上。Size可以调整圆点的大小,可以根据自己的需要去做调整。选择好后,点击Apply预览调整后的图表,没有问题点击OK即可。

添加数据点
图10:添加数据点

6、根据分析得到的roc曲线结果,已经得出最佳cutoff值31.94,接下来我们用虚线在方块图中标出最佳cutoff值。双击Y轴,弹出Format Axes窗口。进入Left Y axis页面。找到Additional ticks and grid lines选项,在下面的At Y=输入数值31.94,勾选右边的Line选项。设置完成后,点击ok按钮即可。

标出最佳cutoff值
图11:标出最佳cutoff值

以上就是关于GraphPad做ROC曲线如何得出cutoff值,GraphPad做ROC曲线怎么添加成方框图的全部内容。在GraphPad中使用软件内提供的“ROC分析”功能,通过输入数据,会自动生成ROC曲线结果,得出Cutoff值。GraphPad软件有着丰富的制图功能,可快速绘制方框图,还可以在图中标出最佳cutoff值。

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