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如何用GraphPad做WB统计 GraphPad Prism如何做Kaplan-Meier分析

发布时间:2026-09-30 10: 00: 00

品牌型号:联想GeekPro 2020

系统:Windows 10 64位专业版

软件版本:Graphpad Prism 10.3.0

‌‌WB统计,即统计免疫印迹(western blot)的实验数据,这种实验可以测出条带灰度值,并进行相关的生物学分析。GraphPad Prism软件本身是没有测条带灰度功能的‌,但可以用来分析其他软件测出的WB数据。我们可以用相关的软件处理一下原始图片,并做归一化处理,这样数据就能导入GraphPad Prism做统计。接下来‌‌,本文将会介绍如何用GraphPad做WB统计,GraphPad Prism如何做Kaplan-Meier分析的相关内容。

一、如何用GraphPad做WB统计

在处理WB图片时,可以用ImageJ将目标蛋白和内参蛋白的WB图片转换成8-bit的灰度图,然后再测量出条带的灰度值。在Excel里用目标蛋白灰度值除以内参蛋白灰度值,就能计算出相对表达量比值,即归一化后的比值数据,建议设置至少3次生物学重复并求取均值。计算出比值数据后,就可以导入GraphPad Prism进行统计分析。

1、在GraphPad Prism的功能中,可以用t检验、ANOVA方差分析等方法分析对比目标蛋白和内参蛋白比值的差异性。如图1所示,在GraphPad Prism的创建窗口中,选择column数据表作为分析表格。

column数据表
图1:column数据表

2、创建了column数据表后,如图2所示,将目标蛋白、内参蛋白的比值分别填写到Group A、B列中,用于对比两组差异的显著性。

导入数据
图2:导入数据

3、整理好数据后,打开GraphPad Prism的分析面板,这里会默认打开column表相关的分析方法,我们要研究的是目标蛋白、内参蛋白的比值差异,因为涉及到的是两组数据,所以要选择t检验。

t检验
图3:t检验

4、打开GraphPad Prism的t检验参数设置后,在数据满足正态分布、方差齐性的情况下,可以直接用软件的默认设置,即使用非配对的参数t检验方法。

实验设计
图4:实验设计

‌5、完成以上设置后,GraphPad Prism就会自动得到图5所示的计算结果,可以看到这里的p值(0.0014)小于0.05,说明目标蛋白与内参蛋白的比值有显著差异。

检验结果
图5:检验结果

二、GraphPad Prism如何做Kaplan-Meier分析

Kaplan-Meier分析是经典的生存分析研究方法,很适合用来做有删失数据的研究项目,在GraphPad Prism软件中,有专门的生存数据表与分析方法供使用,下面让我们来看看GraphPad Prism如何做Kaplan-Meier分析。

1、如图6所示,在GraphPad Prism的创建数据表窗口中,选择“生存数据表”,右侧的选项可以选“输入实际使用时间”,这样就能输入持续天数的数据。

生存数据表
图6:生存数据表

2、创建好生存数据表后,如图7所示,将X列输入“持续的天数”,在Group A、B对应的Y列输入第一、二组的数据,注意数据要按照阶梯式的格式填写,其中1代表死亡,0代表生存或删失。

导入数据
图7:导入数据

3、整理好数据以后,打开GraphPad Prism的分析面板,这里同样会默认打开生存数据表相关的分析方法,如图8所示,我们要选择“简单生存分析(Kaplan-Meier分析)”。

生存分析
图8:生存分析

4、打开GraphPad Prism的生存分析功能后,如图9所示,先确认一下数据中的编码设置是否有误,即“1代表死亡,0代表生存或删失”的设置。

然后,如果要应用Kaplan-Meier分析,需要在“对比两组的计算方法”勾选“Logrank(Mantel-Cox test)”,即比较两组或多组生存曲线是否存在统计学差异。

实验设计
图9:实验设计

4、完成以上设置,就可以得到Logrank(Mantel-Cox test)的检验结果,如图10所示,本例计算得到的p值为0.1563,数值大于0.05,说明两条生存曲线无显著差异。

检验结果
图10:检验结果

三、小结

以上就是如何用GraphPad做WB统计,GraphPad Prism如何做Kaplan-Meier分析的全部内容了。GraphPad Prism拥有丰富的研究分析方法,可以用来应对各种专业、复杂的数据分析,像本文提到的WB数据统计、Kaplan-Meier分析等,都可以用GraphPad Prism做相关的统计运算。除此以外,GraphPad Prism的图表绘制功能也很实用,大家可以试用一下。

作者:泽洋

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标签:GraphPad Prism教程,GraphPad Prism数据分析,GraphPad Prism作图,GraphPad Prism

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