Graphpad Prism是开源的吗 Graphpad Prism可以做pca分析吗

品牌型号：联想GeekPro 2020

系统：Windows 10 64位专业版

软件版本：Graphpad Prism 10.3.0

数据统计分析软件有很多，例如SPSS、Graphpad Prism、Origin、EViews各有各的侧重点，像Graphpad Prism的侧重点就是主要用于生命科学的绘图和统计，它可以做很多的统计分析，比如看区别的显著性、均值差异、相关关系等。对于Graphpad Prism的高阶功能，大家可能也比较感兴趣，接下来我们会介绍Graphpad Prism是开源的吗，以及Graphpad Prism可以做pca分析吗的相关内容。

一、Graphpad Prism是开源的吗

Graphpad Prism虽然暂时不开源，但它的功能其实已经很成熟了，可以覆盖大部分的统计分析问题，可以满足各种分析需要，下面我们来看看Graphpad Prism有哪些好用的功能。

1、刚打开Graphpad Prism，我们就能选择各种数据表。根据不同数据表的特点，Graphpad Prism会推荐常用的分析方法与图表。比如xy数据表，适合用来做散点图，或进行相关性分析等，而column表，则适合对比均值差异，或画柱状图、折线图等。

2、除了各种数据表外，Graphpad Prism的欢迎界面还有很多“学习”功能，比如可以学习怎么用Graphpad Prism、探索进阶的图表，以及学习各种视频资料等，可以让我们很快就上手这款软件。

3、另外，Graphpad Prism还有组合图表的功能。这就意味着我们可以将画好的图表放在同一个版面里面，用来更好地说明数据。这样操作可以节省排版的时间，直接就能从Graphpad Prism导出排好版的图片。

4、Graphpad Prism的分析方法也很多，而且还会按照数据表的类型分类，这样我们就能更快速找到要用的方法。比如，如果选择column表，就会有t test、ANOVA、描述性分析、ROC曲线等方法可以用，这样可以避免用错分析方法。

二、Graphpad Prism可以做pca分析吗

上述提到Graphpad Prism有很多好用的分析方法，其中就包含了聚类统计中很常用的pca分析，也就是探究主成分的方法，下面我们来看看Graphpad Prism是怎么做的。

1、我们先在Graphpad Prism的欢迎界面里，在左边选择“多重变量（multiple variables）”，然后右边的“数据表”选项不动。

2、建好多重变量表后，我们就能填入多个变量的数据，比如这里用了指标1-4的数据，将它们都填进表格里面后，左边就会出现data 1的文件。

3、我们再打开Graphpad Prism的数据分析功能，可以在顶部菜单里面打开。如图7所示，Graphpad Prism会默认打开“多重变量”相关的分析，我们要选择里边的“主成分分析（也就是pca）”。

4、选好pca分析方法后，在弹出来的参数设置里面，切换到“选项（options）”，在方法里面，选择第一个，即标准化（standardize），其他的设置可以保持不动。

5、再切换到“输出结果（output）”，如图9所示，将里面的一些额外报告勾选上，比如变量贡献矩阵、标准化数据、特征向量等，这些报告可以用来辅助数据的解读，比如看看哪些变量贡献大等。

6、如果还想看一些图表表现，可以继续切换到“图表”选项卡，选择一些得分表、碎石图（scree plot），变量占比图等，用图来说明数据会更形象一点。

7、我们来看看Graphpad Prism的pca分析结果，看到图11，PC1、PC2、PC3可以解释85.09%的内容，而PC1、PC2占到63.88%，说明这两个成分比较重要。

8、从特征值、变量占比也能看到，PC1、PC2的解释占比更高，这两个变量是主要的成分，以后要关注它们的表现，而PC3次之。

三、小结

以上就是关于Graphpad Prism是开源的吗，Graphpad Prism可以做pca分析吗的全部内容了。Graphpad Prism虽然暂时不开源，但不用担心，它本身的功能已经很成熟了，可以满足各种类型的分析需要。如果您不熟悉软件的功能，可以用它的帮助内容，里面有视频、文字、图表等资料，内容很丰富，可以很快上手的，推荐大家试用一下。

作者：泽洋