GraphPad Prism如何绘制roc曲线 GraphPad做roc曲线如何得出cutoff值

品牌型号：联想GeekPro 2020

系统：Windows 10 64位专业版

软件版本：GraphPad 10.3.0

roc曲线，是一种绘制在x、y坐标轴组成的二维平面上的曲线，其横坐标对应的是false positive rate（假阳性率），纵坐标对应的是true positive rate（真阳性率）。roc曲线可直观地展示研究对象在不同阈值下的表现情况，本文会给大家介绍GraphPad Prism如何绘制roc曲线，GraphPad做roc曲线如何得出cutoff值的相关内容。

一、GraphPad Prism如何绘制roc曲线

roc曲线研究的是自变量对因变量的预测准确度，并可通过分析cutoff值来获得更优界值。roc曲线的自变量影响因素可以很多种，而因变量主要分为两个类别，如患病与未患病、控制与测试组、阴性与阳性等。

‌在GraphPad Prism软件的操作中，我们可以通过column数据表进行roc曲线的绘制。如图1所示，在GraphPad Prism创建数据功能的左侧栏选择column即可。

column数据表的特点是可以输入多列因变量的数据。上述说到，roc曲线的因变量主要包含两个类别，因此在GraphPad Prism的column数据表中，可根据数据需要输入两列变量数据，本例使用了对照组与患病两组数据。

完成数据的输入后，如图3所示，点击GraphPad Prism顶部快捷工具中的“Analyze”按钮。然后，在弹出的GraphPad Prism column分析方法中选择“roc curve（roc曲线）”选项。

选择了“roc曲线”分析后，如图4所示，在后续的参数设置中确认数据集（Data sets）的设置是否无误，其他选项可以保持默认设置。

GraphPad Prism的roc曲线分析结果包括两部分内容，分别是曲线下面积（roc area）与敏感度&特异性（sensitivity&specificity）。曲线下面积，指的是坐标轴中roc曲线下方的面积，其数值在0.5到1之间（本例为0.9343）。曲线下面积数值越大，说明模型的预测准确度越高。

敏感度与特异性是GraphPad Prism的roc曲线分析结果的另一部分内容，可用于分析cutoff值，以及计算更优界值。其中，敏感度指的是真阳性率，对应roc曲线的横坐标，1-特异性指的是假阳性率，对应的是roc曲线的纵坐标。

上述主要讲解的是roc曲线分析得出的结果，如果要绘制roc曲线，如图7所示，可以点击GraphPad Prism左侧图表输出功能中的“ROC curve：ROC of data1”文件，GraphPad Prism会自动绘制roc曲线。

二、GraphPad做roc曲线如何得出cutoff值

cutoff值是GraphPad做roc曲线后的重要产出结果。roc曲线的横坐标表示假阳性率（1-特异性），即阴性样本中，检测为阳性的比率，其值越低越好；纵坐标表示真阳性率（敏感度），即阳性样本中，检测为阳性的比率，其值越高越好。

在roc曲线上的每一个值，都有其对应的假阳性率与真阳性率组成的坐标点，这些坐标点就是cutoff值。曲线上越靠近坐标轴左上角的cutoff值，其曲线下的面积越大，预测准确率越好。这是因为坐标点越靠近左上角，说明其真阳性率越高，假阳性率越低。

三、小结

以上就是关于GraphPad Prism如何绘制roc曲线，GraphPad做roc曲线如何得出cutoff值的相关内容。GraphPad Prism可通过column数据表中的roc 曲线分析功能得出曲线下面积、敏感度&特异性统计数值，并绘制出roc曲线。按照cutoff值的概念，我们可以在曲线靠近坐标轴左上角的位置上找到更优的界值。

作者：泽洋