用GraphPad如何做多指标联合的roc曲线 GraphPad的roc曲线的最佳截断值怎么找

品牌型号：联想GeekPro 2020

系统：Windows 10 64位专业版

软件版本：GraphPad 10.3.0

多指标联合的roc曲线，指的是基于多个指标来评估模型准确度的roc曲线。当单个指标无法很好地评估模型时，就会引入更准确、更全面的多指标来共同绘制roc曲线。理想的多指标联合的roc曲线应该在多个指标上表现优秀，接下来，本文会演示用GraphPad如何做多指标联合的roc曲线，GraphPad的roc曲线的最佳截断值怎么找的相关内容。

一、用GraphPad如何做多指标联合的roc曲线

GraphPad制作多指标联合roc曲线，是通过将多个roc曲线添加到同一坐标轴的方法实现的。因此，我们需要事先得出不同指标的roc曲线分析结果，然后再将这些结果合并起来。接下来，本文会通过具体例子演示操作。

首先，先进行第一个指标的roc曲线分析。如图1所示，在GraphPad的创建数据表窗口中新建一个column数据表。

roc曲线是一种二分类分析方法，其因变量包括两个分类变量。如图2所示，分别将controls、patients两组数据输入到column数据表的两列表格中。

完成数据的输入后，如图3所示，点击GraphPad顶部快捷功能区的中的“Analyze”按钮，GraphPad会自动定位到适用于column数据表的分析方法中，选择其中的“roc curve（roc曲线）”选项。

然后，在roc曲线分析的参数设置中，确认数据集（data sets）的设置是否与数据表的一致，其他的参数可以保持默认设置不变。

完成roc曲线的分析运算后，如图5所示，在GraphPad左侧功能区的图表输出功能中，点击“ROC curve：ROC of data 1”文件，即可得到基于第一个指标的roc曲线。

重复以上操作，将与第二个指标相关的原始数据输入到GraphPad的新column数据表中，并执行roc曲线分析，得到基于第二个指标绘制出的roc曲线。

完成两个指标的roc曲线绘制后，打开基于第一个指标绘制的roc曲线，双击图表区域，调出图表的格式化窗口。

如图7所示，在图表的格式化窗口中，切换“图表中的数据集”选项卡，此时下方数据集显示的是“data 1”的数据集，点击右侧的“Add”按钮。

然后，如图8所示，在弹出的添加数据集窗口中，选择基于第二个指标绘制的roc曲线数据集（ROC of data 2），并保持绘制在y轴左侧（left）的默认选项，点击OK。

完成以上操作后，GraphPad会将基于第二个指标绘制的roc曲线添加到基于第一个指标绘制的roc曲线所在的坐标轴中，形成多指标联合的roc曲线。

二、GraphPad的roc曲线的最佳截断值怎么找

‌GraphPad的roc曲线包含了横坐标、纵坐标以及一条曲线。其中，横坐标表示假阳性率（1-特异性），即阴性样本中检测为阳性的比率，其值越低越好；纵坐标表示真阳性率（敏感度），即阳性样本中检测为阳性的比率，其值越高越好。

而截断值指的是曲线上的坐标点，每一个坐标点都是一个截断值。那么，最佳截断值怎么找？首先我们要知道，最佳截断值意味着最佳的模型预测准确度，这要求真阳性率尽量高、假阳性率尽量低。基于这一原则，我们只需找到曲线上靠近左上角的坐标点，就能找到最佳截断值。

比如在图10所示的例子中，坐标点（5.556，94.444）是更为靠近左上角的点，因此可将其作为最佳截断值使用。

如果是在roc曲线分析结果中找最佳截断值，可通过计算灵敏度与特异性的和得到。

如图11所示，横坐标的真阳性率即灵敏度，假阳性率即1-特异性，最佳截断值需要满足更高的真阳性率，以及更低的假阳性率，那么在图11列表中，将灵敏度与特异性相加后最大值对应的坐标点即最佳截断值。

三、小结

以上就是关于用GraphPad如何做多指标联合的roc曲线，GraphPad的roc曲线的最佳截断值怎么找的相关内容。GraphPad的多指标联合roc曲线，可通过合并多个指标的roc曲线制作。理想的多指标联合roc曲线，应同时在多个指标下拥有良好的预测准确度，并能通过观察曲线靠近左上角的坐标点找到最佳截断值。

作者：泽洋