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GraphPad如何绘制带分组颜色的热图 GraphPad Prism中如何自定义热图的颜色梯度

发布时间:2025-03-20 10: 00: 00

品牌型号:联想GeekPro 2020

系统:Windows 10 64位专业版

软件版本:GraphPad 10.3.0

热图是一种使用不同颜色代表数值大小的图表形式,常用于分析数据之间的关联、聚类情况等。如果要自己画热图还是比较难的,但通过GraphPad Prism画热图就很简单。GraphPad Prism提供了热图的绘制工具,可使用多种色系绘制专业的热图。接下来,让我们一起来学习下GraphPad如何绘制带分组颜色的热图,GraphPad Prism中如何自定义热图的颜色梯度的相关内容。

一、GraphPad如何绘制带分组颜色的热图

如果想要在GraphPad Prism中绘制带有分组颜色的热图,可以在创建数据表时使用“Grouped”数据表,即行列分组数据表。“Grouped”数据表可在列数据中插入子列来放置多组分列数据。本文会以多组单列数据为例,教大家需要GraphPad如何绘制带分组颜色的热图。

1、如果要创建“Grouped”数据表的多组单列数据,需要在“options”中选择第一项“为每个点输入并绘制一个y值(enter and plot a single y value for each point)”。

分组数据
图1:分组数据

2、创建了多组单列数据表后,如图2所示,输入组别数据,以构造多行列分组数据表。

输入数据
图2:输入数据

3、完成数据的输入后,如图3所示,在GraphPad Prism左侧图表功能区中,点击“Data 1”文件,即上述编辑的分组数据表文件。

创建图表
图3:创建图表

4、在弹出的图表制作功能中,GraphPad Prism会默认显示“Grouped”数据表可创建的图表类型,其中就包含了热图。

分组图表类型
图4:分组图表类型

5、如图5所示,在图表类型中切换“Heat Map(热图)”,即可选择绘制不同类型的热图,其中包括翠绿色、灰度、火焰等类型。本例选择第一个翠绿热图,在下方的预览区域,我们已经可以查看到热图的实际效果,点击右下角的“OK”,即可输出图表。

翠绿热图
图5:翠绿热图

6、GraphPad Prism的热图是根据数据表的中单元格的值进行颜色编码的,因此,热图中的颜色排列是与数据表相对应的。如果数据表有8列,热图也会有8列。如需调整热图的属性,可双击热图打开图表格式化功能。

热图的格式化功能包括背景颜色、形状、大小等,另外也可以设置标题、颜色映射、间距等属性。

热图格式调整
图6:热图格式调整

6、其中间距功能可以设置不同颜色列之间的间隙,如果我们再将数据细分为两个大组,可以通过放大间距的方法让组别之间的区别更明显。比如图7所示,我们将热图左边的4组与右边的4组分设为2个大组,可以勾选“在选定的列中添加额外的间隙”,让两组热图稍微分开,以对比2个大组的数据。

热图间距
图7:热图间距

二、GraphPad Prism中如何自定义热图的颜色梯度

GraphPad Prism热图的颜色梯度是可以自定义的,我们只要双击热图中的色块,就能打开GraphPad Prism的“颜色映射(color mapping)”功能,并进行颜色梯度的自定义。

1、GraphPad的颜色映射提供了映射重复值、彩色类型、色图范围以及超出绘图范围的设置功能。我们可以通过设置色图范围来自定义热图的颜色梯度。

颜色映射
图8:颜色映射

2、在彩色类型中,我们可以设置单色渐变、灰度、彩虹、双色渐变、分类等类型。不同彩色类型,其值的设置范围会有不同,以灰度为例,我们可以选择使用黑色或白色代表较低值,并定制值的范围。GraphPad Prism会根据设定的值范围绘制不同灰度颜色的格子。

颜色类型
图9:颜色类型

3、如果选择翠绿色(Virids)类型,如图10所示,可以在颜色的最大值与最小值中选择“自定义”,并设置目标数值。一般来说,颜色范围的最大值应该稍大于数据中的最大值,但又不能太大。如果颜色范围的最大值过大,会导致热图的颜色区分度不高;如果颜色范围的最大值不够大,会导致部分数值无法显示。

颜色范围
图10:颜色范围

三、小结

以上就是关于GraphPad如何绘制带分组颜色的热图,GraphPad Prism中如何自定义热图的颜色梯度的相关内容。即使我们不懂热图的制作原理,那也没关系。在GraphPad Prism的图表功能中,我们只需在GraphPad Prism的grouped数据表中输入数据,就能快速绘制热图。热图的绘制过程中,我们也无需设置颜色编码等复杂信息,GraphPad Prism会自动完成设置。

作者:泽洋

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